Agencija za energijo na podlagi določb Energetskega zakona z odločbo certificira operaterja prenosnega sistema zemeljskega plina, če ta izpolnjuje zakonske zahteve lastniškega ločevanja operaterja prenosnega sistema ali zakonske zahteve neodvisnega operaterja prenosnega sistema zemeljskega plina.

Agencija je 11. julija 2012 izdala odločbo o certificiranju, s katero je bilo ugotovljeno, da družba Plinovodi, d.o.o., izpolnjuje vse zahteve za izvajanje nalog neodvisnega operaterja prenosnega sistema zemeljskega plina (ITO) in se jo certificira. Odločba je postala pravnomočna in dokončna 16. julija 2012.